Ditambah lagi di bangunan museum ini juga terdapat peninggalan bersejarah berupa arca-arca berbentuk Hindu dan Budha, Arca Siwa, dan Roro Jonggrang.
Kemudian Museum Radya Pustaka, juga mempunyai banyak sekali koleksi yang terdiri dari pusaka adat, arca, buku-buku kuno seperti buku Wulangreh karangan Pakubuwono IV, dan wayang kulit.
Museum ini juga memiliki peninggalan lain yang berskala nasional hingga internasional.
Seperti peninggalan tentang perjuangan pemuda tanah jawa dalam mempertahankan kemerdekaan.
Sedangkan, untuk peninggalan yang berskala internasional, yaitu sebuah koleksi kotak musik yang berasal dari Perancis dengan berhiaskan bunga yang menancap diantara burung-burung kecil.