Hingga pada akhir 1974 Museum Sonobudoyo diserahkan ke Pemerintah Pusat.
Museum Sonobudoyo menyimpan keramik pada zaman Neolitik dan patung perunggu dari abad ke-8, serta beberapa macam bentuk wayang kulit, berbagai senjata kuno (termasuk keris dan topeng Jawa).
Koleksi Museum Sonobudoyo terbagi menjadi 10 jenis yaitu:
- Koleksi Numismatik dan Heraldika
- Koleksi Filologi
- Koleksi Keramologika
- Koleksi Seni rupa
- Koleksi Teknologi
- Koleksi Geologi
- Koleksi Biologi
- Koleksi Arkeologi
- Koleksi Etnografi
- Koleksi Historika